据志书记载：漳州文庙始建于宋庆历四年(1044)。按宋代制度，孔庙与官学(亦称学宫)并建一处，这个制度一直延续至清代。宋政和二年(1112)文庙与官学移于州左。后因漳州历年科举中式锐减，绍兴九年(1139)，知州李弥逊应诸生之请复故址。

    当时漳州文庙建置有棂星门、仪门、戟门、大成殿、东西两庑、泮池和讲堂、十斋等。十一年(1141)建成。次年即有颜师鲁等5人登进士第。在封建时代，出于忠君尊孔和科举取士的需要，官员对文庙和学宫都给予充分的重视。如宋绍熙元年(1190)，朱熹知漳州事，“每旬之二日必领官属下州学，视诸生，讲小学，为正其义”，在州学创宾贤斋，延请郡士黄樵仲、施允焘、石洪庆、李唐咨、林易简、陈淳、杨士训及永嘉徐寓等八人于学；又创受成斋以教养武生。他奏乞褒录，为直言忤秦桧而被贬死容州的漳浦高登立祠于学宫。议定以太学之制扩大斋舍规模，因离任未果。以后又于宋嘉定十六年(1223)知州郑(左日右方)和元代延(左衣右右)三年(1316)，总管张泉逸、教授高元子再次重修，建置有大成殿、两庑、戟门、棂星门、杏坛、明伦堂、书楼以及泮池等。元天历二年(1329)，达鲁花赤纳儿占伯重修。明成化十五年(1479)漳城洪灾，文庙倾坏，十八年(1482)知府姜谅更新之。同时，请同年进士李东阳(弘治八年任文渊阁大学士)撰写《漳州府进士题名录》。隆庆四年(1570)，飓风坏屋瓦，知府罗青霄重修。清乾隆八年(1743)，巡道王廷诤、知府张廷球、周岱重修。据现存石刻碑记所及，尚有明正统十年(1445)陈祚，明成化三年(1467)，明崇祯八年 (1635)曹荃，清康熙五年(1666)郑燠，民国十四年(1925)张毅，民国二十五年(1936)蒋鼎文等六次重修。明清以来还有多次对明伦堂、大成殿以及丽藻池、两庑等处的修建。据清光绪《漳州府志》卷首府学图，文庙仍依宋制“左庙右学”。文庙前道路的左右建有“德配天地”、“道冠古今”两牌坊、大门左边立有一石碑，镌刻：“文武官员到此下马”字样。进内就是棂星门、戟门、东西两庑、大成殿。右边府学部分建有训导署、启圣祠、明伦堂、教谕署、名宦祠、乡贤祠、土地祠、闵公祠、泮池、游圣之门以及学舍；府学大门内，悬挂“海滨邹鲁”匾额的应为经阁。

    民国期间，漳州文庙被占为军队营房，也曾做为警察局。1949年以后改成小学校舍。1988年列为漳州市第一批市级文物保护单位。1991年，市政府对戟门、两庑进行维修。1996年被列为省级文物保护单位。1999年12月，根据国家文物局批准的维修设计方案，市政府聘请中国文物研究所高级工程师为指导，历时一年完成对大成殿的维修，

    2001年元旦对游人开放。漳州文庙历经900年沧桑，屡废屡兴，见证了中华传统文化在漳州大地上源远流长，成为漳州这一国家历史文化名城的代表性建筑。

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